Profil
Proteome Factory
Das Biotechnologieunternehmen Proteome Factory AG ist auf Proteomik, Biomarker/Target-Findung und Validierung, Proteinanalyse sowie Proteomik-Bioinformatik spezialisert und ist damit ein Komplettanbieter für differentielle Proteomanalyse und Proteinanalytik. Diese hochmoderne Technologieplattform wird ständig weiterentwickelt und stellt den Kunden und Partnern der Proteome Factory eine der modernsten und innovativsten Schlüsseltechnologien für die Proteomik zur Verfügung. Sie dient ferner als Ausgangspunkt für die Entwicklung und Patentierung innovativer Technologien und Produkte, in die die langjährige praktische und theoretische Erfahrung des Teams der Proteome Factory einfließt.
Auftragsforschung
Proteome Factory bietet seine Proteomik-Technologieplattform und sein Know how im Rahmen von Auftragsforschungsprojekten Kunden aus der Pharma-, Lebensmittel- und Biotechnikindustrie an. Diese Projekte haben normalerweise eine mehrmonatige bis mehrjährige Laufzeit und werden durch einen Wissenschaftler der Proteome Factory betreut. Neben standardisierten Analysen aus dem Portfolio der Proteome Factory werden dabei bei Bedarf auch neue Methoden projektspezifisch etabliert oder entwickelt. Auch kann auf Kooperationspartner aus dem Scitrix-Netzwerk und VWRBioscienes effektiv zurückgegriffen werden.
Neben der Proteomanalyse zur Identizierung regulierter Proteine, der Biomarker- und Target-Findung gewinnt zunehmend die Validierung proteinogener Zielmoleküle mit SRM- und MRM-Analysen (Selected Reaction Monitoring, Multiple Reaction Monitoring, Mass Western) an Bedeutung. Proteome Factory setzt dabei zur absoluten Quantifizierung von Peptiden und Proteinen nach proteolytischer Spaltung in Peptide synthetische Peptide ein, die mit stabilen Isotopen markiert sind (sogenannte heavy peptides).
Seit Neustem werden auch MeCAT-Analysen zur absoluten Quantifizierung von Proteinen und Peptiden für pharmakokinetische Studien mit einer Nachweisgrenze im unteren Attomol-Bereich angeboten, zukünftig auch im Zeptomolbereich, wodurch therapeutische Proteine und Antikörper besser und exakter quantifiziert werden können. Im Bereich der Qualitätssicherung und Qualitätskontrolle wird MeCAT eine exakte Mengenbestimmung von therapeutischen Proteinwirkstoffen in geringsten Konzentrationen in Einzeldosen ermöglichen, wodurch z.B. hochgiftige und damit hochwirksame Wirkstoffe exakter dosiert werden können.
Die Komplettsequenzierung von Proteinen und Antikörpern ist ein weiterer Bereich der Auftragsforschung von Proteome Factory, um z.B. die variablen Bereiche und CDR von Antikörpern zu bestimmen.
Auftragsanalytik
Auftragsanalysen wie kleine Proteomstudien, Proteinanalytik, Proteinidentifizierung und Proteinsequenzierung werden im Rahmen von fee-for-service Dienstleistungen als Standardanalysen angeboten. Preisangaben zu den Standardanalysen können Sie bei Proteinanalytik und Identifkation entnehmen.
Produkte
Proteome Factory bietet Handhabungssysteme für die Proteomik an. Der Hochdurchsatz-Spotstanzroboter spotXpress kann bis zu 800 Proteinspots pro Stunde aus 2DE Gelen auszustanzen und ist damit der weltweit schnellste Spotstanz-Roboter mit patentierter pneumatischer Stanztechnologie. Das Probenvorbereitungssystem spotDigest 96 ermöglicht eine effektive Probenvorbereitung von Proteinspots für die MS-Anayltik.
Einen weiteren Produktbereich stellt die bioinformatische Software zur Proteinidentifizierung (Peptide Workbench) und de novo Peptidsequenzierung (Sequit!) da.
Proteomik-Kits zur MeCAT-Metallmarkierung für die absolute Proteinquantifizierung, Anreicherung von Phosphoproteinen, auflösbare DPAGE Gele, MS kompatibele Silber- und Fluoreszenfärbung runden das Produktangebot der Proteome Factory ab.
Schlüsseltechnologie der nächsten Generation
Die in Deutschland patentierte und international zum Patent angemeldete MeCAT Technologie stellt die Schlüsseltechnologie der nächsten Generation für die absolute Proteinquantifizierung mittels ICP-Massensspektrometrie da. Ihre ultrasensitive Nachweisempfindlichkeit für Proteine liegt schon heutzutage im unteren Attomol-Bereich und ist damit um mehrere Größenordnungen empfindlicher als andere bestehende massenspektrometrische Verfahren. Eine weitere Sensitivitätssteigerung um 2 bis 3 Größenordnungen liegt im realistischen Bereich, wenn die bisher fast ausschließlich in der Umwelt- und Elementanalytik eingesetzten ICP-MS Geräte und das MeCAT-Analysverfahren weiter optimiert werden. Die ICP-MS bietet darüberhinaus einen bisher in der Bioanalytik nicht ansatzweise ereichten linearen dynamischen Meßbereich von über 6-8 Größenordnungen (Determinationskoeffizient R2 besser 0,9999), der damit erstmals in den Bereich des dynamischen Konzentrationsbreiches von Proteinen in Zellen und Körperflüssigkeiten vordringt. Regulatorische Proteine wie Transkriptionsfaktoren liegen oft in wenigen Kopien vor, während andere Proteine wie z.B. Strukturproteine in vielen Millionen Kopien pro Zelle vorliegen können.
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